Estimasi Ketidakpastian Pengukuran Mikrobiologi (Bagian 3)
6.3. Penentuan Ketidakpastian Distribusional
6.3.1. Ketidakpastian Distribusional Metode Hitungan Cawan
Pada metode hitungan cawan terdapat dua ketidakpastian distribusional yaitu ketidakpastian Poisson dan konfirmasi. Ketidakpastian konfirmasi hanya berlaku jika metode memakai uji konfirmasi setelah uji presumtif.
6.3.1.1. Ketidakpastian Poisson
Ketidakpastian distribusional minimal yang ada tergantung kepada jumlah total koloni (ΣC) yang didapat. Tabel berikut memberikan informasi mengenai ketidakpastian standar Poisson (uPoisson) dalam unit log10 untuk jumlah koloni 1 sampai 40.
Tabel 2. Nilai uPoisson dalam unit log10 untuk jumlah koloni 1sampai 40. Diadaptasi dari “ISO 19036: 2019. Microbiology of the food chain – Estimation of Measurement Uncertainty for Quantitative Determination”, oleh ISO, 2019, hal. 17.
ΣC | uPoisson | ΣC | uPoisson | ΣC | uPoisson | ΣC | uPoisson |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | 0,434 | 11 | 0,131 | 21 | 0,095 | 31 | 0,078 |
2 | 0,307 | 12 | 0,125 | 22 | 0,093 | 32 | 0,077 |
3 | 0,251 | 13 | 0,120 | 23 | 0,091 | 33 | 0,076 |
4 | 0,217 | 14 | 0,116 | 24 | 0,089 | 34 | 0,074 |
5 | 0,194 | 15 | 0,112 | 25 | 0,087 | 35 | 0,073 |
6 | 0,177 | 16 | 0,109 | 26 | 0,085 | 36 | 0,072 |
7 | 0,164 | 17 | 0,105 | 27 | 0,084 | 37 | 0,071 |
8 | 0,154 | 18 | 0,102 | 28 | 0,082 | 38 | 0,070 |
9 | 0,145 | 19 | 0,100 | 29 | 0,081 | 39 | 0,070 |
10 | 0,137 | 20 | 0,097 | 30 | 0,079 | 40 | 0,069 |
Jika ΣC = 0, maka uPoisson = 0,4343
Namun jika ΣC lebih dari 40 maka dapat dihitung dengan rumus :
uPoisson = 0,4343 / (√ΣC)
Contoh :
jika ΣC = 100, maka
uPoisson = 0,4343/ (√100)
uPoisson = 0,4343/ (10)
uPoisson = 0,04343
6.3.1.2. Ketidakpastian Konfirmasi
Uji konfirmasi untuk mengkoreksi uji presumptif dalam metode hitungan cawan juga memberikan efek ketidakpastian. Ketidakpastian ini dapat dicari dengan rumus :
uconf = 1/2,303.√((nc+0,5)(np-nc+0,5)np2)/((np+1)2(np+2)nc2)
keterangan :
np : jumlah koloni presumptif yang diuji,
nc : jumlah koloni terkonfirmasi
jika nc = 0, maka uconf dihitung sama seperti jika nc =1
Untuk memdudahkan berikut tabel nilai uConf untuk beberapa angka tertentu.
Tabel 3. Nilai uconf untuk beberapa angka tertentu (dalam log10). Diadaptasi dari “ISO 19036: 2019. Microbiology of the food chain – Estimation of Measurement Uncertainty for Quantitative Determination”, oleh ISO, 2019, hal. 18.
nc | np | |||
---|---|---|---|---|
5 | 10 | 15 | 20 | |
1 | 0,35533 | 0,43016 | 0,46045 | 0,47684 |
2 | 0,20228 | 0,26265 | 0,28679 | 0,29980 |
3 | 0,13485 | 0,19461 | 0,21768 | 0,23000 |
4 | 0,08883 | 0,15407 | 0,17756 | 0,18993 |
5 | 0,04536 | 0,12535 | 0,15006 | 0,16281 |
6 | 0,10272 | 0,12931 | 0,14266 | |
7 | 0,08340 | 0,11261 | 0,12674 | |
8 | 0,06566 | 0,09854 | 0,11360 | |
9 | 0,04780 | 0,08620 | 0,10239 | |
10 | 0,02611 | 0,07503 | 0,09258 | |
11 | 0,06457 | 0,08378 | ||
12 | 0,05442 | 0,07573 | ||
13 | 0,04412 | 0,06824 | ||
14 | 0,03289 | 0,06114 | ||
15 | 0,01832 | 0,05427 | ||
16 | 0,04748 | |||
17 | 0,04059 | |||
18 | 0,03331 | |||
19 | 0,02510 | |||
20 | 0,01411 |
Semakin tinggi jumlah yang terkonfirmasi maka ketidakpastiannya semakin rendah. Semakin besar jumlah koloni yang diuji semakin rendah juga ketidakpastiannya.
Contoh :
np : 10 koloni
nc : 4 koloni
uconf = 1/2,303.√((nc+0,5)(np-nc+0,5)np2)/((np+1)2(np+2)nc2)
= 1/2,303.√((4+0,5)(10-4+0,5)102)/((10+1)2(10+2)42)
= 0,15407 (dalam log10)
6.3.2. Ketidakpastian Distribusional Metode MPN
Ketidakpastian MPN memiliki nilai yang lebih besar daripada ketidakpastian Poisson karena adanya unsur probabilitas binomial yang berhubungan dengan hasil positif atau negatif tabung. Ketidakpastian standar MPN juga disebut sebagai standar eror diekspresikan dengan satuan log10 MPN/g atau MPN/ml.
uMPN = (1/(ln(10)) / µ√Σ((xi.mi2.exp(-mi.µ))/(1-exp(-mi.µ)2)
uMPN : ketidakpastian distribusional MPN
µ : nilai MPN/g atau ml, bukan dalam log10
xi : jumlah hasil positif pada pengenceran ke-i
mi : jumlah sampel (g atau ml) setiap pengenceran ke-i
k : jumlah pengenceran
‘exp’ adalah bukan notasi namun operasi matematika yaitu ex atau inversi ln x. Konstanta e adalah 2,71828182845904. Jika menggunakan Excel® maka dapat menggunakan fungsi “=EXP”.
Jika Σxi = 0 atau tidak ada hasil positif di setiap pengenceran, maka uMPN dihitung dengan menganggap adanya 1 tabung positif pada pengenceran terrendah (terkonsentrasi).
Contoh :
MPN 5×3 tabung dengan hasil positif 4-0-1 dan indeks MPN = 1,7 MPN/g
mi | xi | ((xi.mi2.exp(-mi.µ))/(1-exp(-mi.µ)2) |
1 | 4 | 1,093903 |
0,1 | 0 | 0 |
0,01 | 1 | 0,346012 |
Σ = | 1,439916 |
µ = | 1,7 | MPN/g |
1/ln(10) = | 0,434294 | |
uMPN = | 0,212896 | log10 MPN/g |
Jika rumus diatas digunakan untuk menghitung data pada tabel MPN 3×3 dengan inokulum 1, 0,1 dan 0,01 g maka didapatkan data ketidakpastian MPN sebagai berikut.
Tabel 4. MPN 3×3 tabung dengan inokulum 1, 0,1 dan 0,01 g beserta nilai ketidakpastian MPN (uMPN). Diambil dari dokumentasi pribadi.
Tabung positif | µ (MPN/g) |
uMPN
(log10 MPN/g) |
||
---|---|---|---|---|
1 | 0,1 | 0,01 | ||
0 | 0 | 0 | <0,3 | 0,437 |
0 | 0 | 1 | 0,3 | 0,434 |
0 | 1 | 0 | 0,3 | 0,434 |
0 | 1 | 1 | 0,61 | 0,307 |
0 | 2 | 0 | 0,62 | 0,307 |
0 | 3 | 0 | 0,94 | 0,251 |
1 | 0 | 0 | 0,36 | 0,437 |
1 | 0 | 1 | 0,72 | 0,310 |
1 | 0 | 2 | 1,1 | 0,255 |
1 | 1 | 0 | 0,74 | 0,311 |
1 | 1 | 1 | 1,1 | 0,255 |
1 | 2 | 0 | 1,1 | 0,255 |
1 | 2 | 1 | 1,5 | 0,222 |
1 | 3 | 0 | 1,6 | 0,223 |
2 | 0 | 0 | 0,92 | 0,318 |
2 | 0 | 1 | 1,4 | 0,264 |
2 | 0 | 2 | 2 | 0,234 |
2 | 1 | 0 | 1,5 | 0,266 |
2 | 1 | 1 | 2 | 0,234 |
2 | 1 | 2 | 2,7 | 0,214 |
2 | 2 | 0 | 2,1 | 0,236 |
2 | 2 | 1 | 2,8 | 0,215 |
2 | 2 | 2 | 3,5 | 0,199 |
2 | 3 | 0 | 2,9 | 0,217 |
2 | 3 | 1 | 3,6 | 0,200 |
3 | 0 | 0 | 2,3 | 0,310 |
3 | 0 | 1 | 3,8 | 0,306 |
3 | 0 | 2 | 6,4 | 0,293 |
3 | 1 | 0 | 4,3 | 0,328 |
3 | 1 | 1 | 7,5 | 0,304 |
3 | 1 | 2 | 12 | 0,256 |
3 | 1 | 3 | 16 | 0,223 |
3 | 2 | 0 | 9,3 | 0,316 |
3 | 2 | 1 | 15 | 0,266 |
3 | 2 | 2 | 21 | 0,236 |
3 | 2 | 3 | 29 | 0,217 |
3 | 3 | 0 | 24 | 0,315 |
3 | 3 | 1 | 46 | 0,340 |
3 | 3 | 2 | 110 | 0,322 |
Sedangkan jika rumus diatas digunakan untuk menghitung data pada tabel MPN 5×3 dengan inokulum 0,1, 0,01 dan 0,001 g maka didapatkan data ketidakpastian MPN sebagai berikut.
Tabel 5. MPN 5×3 tabung dengan inokulum 0,1, 0,01 dan 0,001 g beserta nilai ketidakpastian MPN (uMPN). Diambil dari dokumentasi pribadi.
Tabung positif | µ | uMPN | Tabung positif | µ | uMPN | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0,1 | 0,01 | 0,001 | 0,1 | 0,01 | 0,001 | ||||
0 | 0 | 0 | <1,8 | 0,435 | 4 | 0 | 2 | 21 | 0,198 |
0 | 0 | 1 | 1,8 | 0,434 | 4 | 0 | 3 | 25 | 0,186 |
0 | 1 | 0 | 1,8 | 0,434 | 4 | 1 | 0 | 17 | 0,213 |
0 | 1 | 1 | 3,6 | 0,307 | 4 | 1 | 1 | 21 | 0,198 |
0 | 2 | 0 | 3,7 | 0,307 | 4 | 1 | 2 | 26 | 0,188 |
0 | 2 | 1 | 5,5 | 0,251 | 4 | 1 | 3 | 31 | 0,179 |
0 | 3 | 0 | 5,6 | 0,251 | 4 | 2 | 0 | 22 | 0,200 |
1 | 0 | 0 | 2 | 0,435 | 4 | 2 | 1 | 26 | 0,188 |
1 | 0 | 1 | 4 | 0,308 | 4 | 2 | 2 | 32 | 0,180 |
1 | 0 | 2 | 6 | 0,252 | 4 | 2 | 3 | 38 | 0,173 |
1 | 1 | 0 | 4 | 0,308 | 4 | 3 | 0 | 27 | 0,190 |
1 | 1 | 1 | 6,1 | 0,252 | 4 | 3 | 1 | 33 | 0,182 |
1 | 1 | 2 | 8,1 | 0,219 | 4 | 3 | 2 | 39 | 0,174 |
1 | 2 | 0 | 6,1 | 0,252 | 4 | 4 | 0 | 34 | 0,183 |
1 | 2 | 1 | 8,2 | 0,219 | 4 | 4 | 1 | 40 | 0,175 |
1 | 3 | 0 | 8,3 | 0,219 | 4 | 4 | 2 | 47 | 0,167 |
1 | 3 | 1 | 10 | 0,196 | 4 | 5 | 0 | 41 | 0,176 |
1 | 4 | 0 | 11 | 0,196 | 4 | 5 | 1 | 48 | 0,168 |
2 | 0 | 0 | 4,5 | 0,310 | 5 | 0 | 0 | 23 | 0,240 |
2 | 0 | 1 | 6,8 | 0,254 | 5 | 0 | 1 | 31 | 0,236 |
2 | 0 | 2 | 9,1 | 0,221 | 5 | 0 | 2 | 43 | 0,239 |
2 | 1 | 0 | 6,8 | 0,254 | 5 | 0 | 3 | 58 | 0,232 |
2 | 1 | 1 | 9,2 | 0,221 | 5 | 1 | 0 | 33 | 0,244 |
2 | 1 | 2 | 12 | 0,199 | 5 | 1 | 1 | 46 | 0,248 |
2 | 2 | 0 | 9,3 | 0,221 | 5 | 1 | 2 | 63 | 0,238 |
2 | 2 | 1 | 12 | 0,199 | 5 | 1 | 3 | 84 | 0,217 |
2 | 2 | 2 | 14 | 0,182 | 5 | 2 | 0 | 49 | 0,256 |
2 | 3 | 0 | 12 | 0,199 | 5 | 2 | 1 | 70 | 0,245 |
2 | 3 | 1 | 14 | 0,182 | 5 | 2 | 2 | 94 | 0,220 |
2 | 4 | 0 | 15 | 0,183 | 5 | 2 | 3 | 120 | 0,199 |
3 | 0 | 0 | 7,8 | 0,257 | 5 | 2 | 4 | 150 | 0,183 |
3 | 0 | 1 | 11 | 0,225 | 5 | 3 | 0 | 79 | 0,252 |
3 | 0 | 2 | 13 | 0,202 | 5 | 3 | 1 | 110 | 0,225 |
3 | 1 | 0 | 11 | 0,225 | 5 | 3 | 2 | 140 | 0,204 |
3 | 1 | 1 | 14 | 0,204 | 5 | 3 | 3 | 180 | 0,189 |
3 | 1 | 2 | 17 | 0,187 | 5 | 3 | 4 | 210 | 0,176 |
3 | 2 | 0 | 14 | 0,204 | 5 | 4 | 0 | 130 | 0,233 |
3 | 2 | 1 | 17 | 0,187 | 5 | 4 | 1 | 170 | 0,213 |
3 | 2 | 2 | 20 | 0,175 | 5 | 4 | 2 | 220 | 0,200 |
3 | 3 | 0 | 17 | 0,188 | 5 | 4 | 3 | 280 | 0,192 |
3 | 3 | 1 | 21 | 0,176 | 5 | 4 | 4 | 350 | 0,185 |
3 | 3 | 2 | 24 | 0,166 | 5 | 4 | 5 | 430 | 0,178 |
3 | 4 | 0 | 21 | 0,176 | 5 | 5 | 0 | 240 | 0,244 |
3 | 4 | 1 | 24 | 0,166 | 5 | 5 | 1 | 350 | 0,253 |
3 | 5 | 0 | 25 | 0,167 | 5 | 5 | 2 | 540 | 0,268 |
4 | 0 | 0 | 13 | 0,233 | 5 | 5 | 3 | 920 | 0,258 |
4 | 0 | 1 | 17 | 0,213 | 5 | 5 | 4 | 1600 | 0,241 |
6.4. Penentuan Ketidakpastian Dikombinasi
Ketidakpastian dikombinasi adalah penggabungan dari setiap ketidakpastian standar yang berpengaruh terhadap analisis.
6.4.1. Kombinasi dari Ketidakpastian Standar Terpisah
Kombinasi ini dihitung dengan menggabungkan setiap ketidakpastian standar dengan rumus umum berikut.
uc(y) = √ ua2+ub2+uc2
uc(y) : ketidakpastian dikombinasi
ua,b,c : ketidakpastian standar (dapat berupa utech, umatrix dll.)
Efek dari suatu ketidakpastian standar dapat diabaikan jika perbandingan ketidakpastian standar tersebut dengan ketidakpastian standar terbesar tidak lebih dari 1/5. Umumnya nilai terbesar dimiliki oleh utech sehingga jika ketidakpastian standar lain sangat kecil dan dapat diabaikan maka uc(y) = utech.
6.4.1.1. Untuk Metode Hitungan Cawan tanpa Uji Konfirmasi
Metode yang dicakupi umumnya memakai media non spesifik (spread plate, pour plate atau filtrasi membran), diantaranya adalah metode APC dan yeast & mold. Ketidakpastian standar yang perlu dimasukkan adalah :
uc (y) = √ utech2+umatrix2+uPoisson2
6.4.1.2. Untuk Metode Hitungan Cawan dengan Uji Konfirmasi
Metode yang dicakupi umumnya memakai media spesifik (spread plate, pour plate atau filtrasi membran), diantaranya metode perhitungan adalah S.aureus, C.perfringens, E.coli dll. Ketidakpastian standar yang perlu dimasukkan adalah :
uc (y) = √ utech2+umatrix2+uPoisson2+uconf2
6.4.1.3. Untuk Metode MPN
Dipakai untuk metode MPN semua seri dan kombinasi. Perlu diingat, metode MPN umumnya memakai uji konfirmasi, tetapi tidak dibutuhkan untuk menambahkan uconf. Ketidakpastian standar yang perlu dimasukkan adalah :
uc (y) = √ utech2+umatrix2+uMPN2
6.4.1.4. Untuk Metode Mikrobiologi Instrumental
Dipakai untuk metode mikrobiologi tanpa perhitungan koloni, seperti ATP bioluminescence. Ketidakpastian standar yang perlu dimasukkan adalah :
uc (y) = √ utech2+umatrix2
6.4.2. Kombinasi Berdasarkan Standar Deviasi Reproducibility
Jalan ini dapat dipilih jika sesuai dengan kebutuhan pelanggan atau protokol laboratorium tertentu. Nilai standar deviasi reproducibility saja dapat langsung menjadi ketidakpastian dikombinasi, dengan rumus :
uc (y) = sR
6.7. Penentuan Ketidakpastian Diperluas
Ketidakpastan diperluas dihitung dari ketidakpastian dikombinasi dengan rumus :
U = k.uc (y)
k : adalah faktor cakupan (coverage factor), umumnya digunakan nilai 2 dengan tingkat kepercayaan 95%.
Nilai ketidakpastian diperluas ini sebaiknya memiliki 2 angka signifikan.
7. Pelaporan Estimasi Ketidakpastian Pengukuran
7.1. Pelaporan Ketidakpastian Jika Hasil diatas LOQ
Setelah didapatkan ketidakpastian diperluas, maka nilai tersebut dapat disertakan dalam pelaporan akhir hasil analisis. Beberapa bentuk pelaporan ketidakpastian pengukuran yang disarankan adalah:
- y ± U log10 (CFU/g atau CFU/ml)
misal : 5,0 ± 0,31 log10 CFU/g
- y log10 (CFU/g atau CFU/ml) [y- U; y+U]
misal : 5,0 log10 CFU/g [4,69; 5,31]
- x (CFU/g atau CFU/ml) [10 y- U; 10 y+U]
misal : 1 x 105 CFU/g [4,9 x 104; 2,0 x 105]
Contoh Perhitungan :
Misalnya dalam suatu analisis menggunakan metode APC pada sosis, didapatkan data :
103 | 104 | ΣC | x |
102 | 8 | 110 | (110/1,1)x103 = 1×105 |
utech = 0,259 log10 CFU/g
(dari contoh perhitungan intralaboratory reproducibility).
umatrix = 0,2482 log10 CFU/g
(dari contoh perhitungan pengujian porsi uji).
uPoisson = 0,4343/√ ΣC
= 0,4343/√110
= 0,0414 log10 CFU/g
uPoisson /utech
= 0,0414/0,259
=.0,276 (> 0,2)
maka uPoisson tidak diabaikan
uc (y) = √ utech2+umatrix2+uPoisson2
= √ 0,2592+0,24822+0,04142
= √ 0,1303982
= 0,361106909
U = k.uc (y)
= 2. 0,361106909
= 0,722213819
= 0,72 log10 CFU/g (diambil 2 angka penting)
Pelaporan = y ± U log10 CFU/g
= 1×105 CFU/g ± 0,72 log10 CFU/g
= 1×105 ± 5,24 CFU/g
= 5,0 ± 0,72 log10 CFU/g
7.2. Pelaporan Ketidakpastian Jika Hasil dibawah LOQ
Hasil analisis disebut dibawah LOQ jika:
ΣC = 0, tidak ada koloni dihitung untuk hitungan cawan
nc = 0, tidak ada koloni terkonfirmasi untuk hitungan cawan
xi = 0, untuk semua i, atau tidak ada tabung positif untuk MPN
Maka pelaporannya menjadi :
- < yLOQ ± U log10 (CFU/g atau CFU/ml)
- < yLOQ log10 (CFU/g atau CFU/ml) [<yLOQ-U; yLOQ+U]
- < xLOQ (CFU/g atau CFU/ml) [0; 10 yLOQ+U]
xLOQ : nilai LOQ dalam CFU/g atau CFU/ml
Contoh Perhitungan :
Misalnya dalam suatu analisis menggunakan metode APC pada sosis, didapatkan data :
103 | 104 | ΣC | x |
0 | 0 | 0 | (1/1,1)x101 |
utech = 0,15 log10 CFU/g
umatrix = 0,10 log10 CFU/g
uPoisson = 0,4343/√ ΣC
= 0,4343/√ 1
= 0,0434 log10 CFU/g
uc (y) = √ utech2+umatrix2+uPoisson2
= √ 0,152+0,102+0,04342
= √ 0,2209
= 0,470
U = k.uc (y)
= 2. 0,470
= 0,94 log10 CFU/g
xLOQ dihitung dari satu koloni yang dihitung sehingga ΣC =1.
xLOQ = 10d1 (ΣC/1,1)
= 101 (1/1,1)
= 9,091 CFU/g
yLOQ = log10 (9,091)
= 0,959 log10 CFU/g.
Pelaporan = < yLOQ ± U
= < 0,96 ± 0,94 log10 CFU/g.
Referensi
ISO 16140-3: 2017. (2017). Microbiology of the food chain — Method validation — Part 3: Protocol for the verification of reference and validated alternative methods implemented in a single laboratory
ISO 19036: 2019. (2019). Microbiology of the food chain – Estimation of Measurement Uncertainty for Quantitative Determination.
KAN G-01 (2011). Guide on Measurement Uncertainty
Indra Pradhika, 2019.
Terimakasih atas ilmunya.. Saya ingin bertanya mas, untuk menghitung ketidakpastian metode MPN, bagaimana cara menghitung ketidakpastian teknis dan ketidakpastian matriksnya?
u matriks dan u teknis metode MPN dihitung dengan cara yang sama dengan PC mbak, sesuai yg telah dijelaskan. yg membedakan di MPN hanya pada saat perhitungan u distb saja